根據臺灣衛生署的統計數字，迄今為止臺灣共有483宗薩斯病例，60人死亡。
此前，世界衛生組織建議，應該取消前往臺灣的一切不必要旅行。
雖然世界各地的薩斯疫情已經開始緩和，但是世界衛生組織警告說"臺灣是目前疫症爆發最迅速的地區"。
臺灣是在中國大陸和香港之後，疫情最嚴重的地區。
醫院保護措施
臺灣衛生當局星期三（5月21日）要求各醫院採取嚴格保護措施，以防止病人與員工之間發生互相傳染嚴重呼吸系統綜合症。臺灣週三公布了35宗新病例。
臺灣超過90%的嚴重急性呼吸系統綜合症病例都是在醫院感染的。目前已經有超過150名醫院醫護人員辭職，抗議保護不足。
臺灣中央研究院院長李遠哲說，醫院內感染是疫情高峰不退的主因，所以最主要的工作是控制院內感染。
對於臺灣沒能加入世界衛生組織當觀察員，李遠哲表示，如果未來一兩年臺灣在診斷試劑和疫苗的研發方面有成果，相信對臺灣以觀察員身份加入世界衛生組織有幫助。
世界衛生組織已經派出更多衛生專家到臺灣，臺灣當局正考慮招聘200多名傳染病控制專家來控制疫情。
另一方面，臺灣行政院星期三首次重罰隱瞞疫情的醫院，臺灣南部的高雄的長庚醫院和高雄醫學院附設醫院將會被重罰台幣150萬元。
防止擴散南部
臺灣疾病管制中心方面說，政府將會加強控制疫症在南部地區擴散。
當局警告說，臺灣南部未來可能出現新一波嚴重呼吸系統綜合症襲擊。
臺灣國防部表示，將會把另外四家軍方醫院用作治療嚴重急性呼吸系統綜合症用途。本週初，松山軍醫院已經改作這種醫療用途。
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